據大紀元8月6日報道，馬祖是臺灣安全的前哨，兩岸開放往來後，通商和探親人數迅速增加，當地漁民們組成了負責兩岸小三通的運輸船隊，號稱「北海艦隊」。但是，目前因爲大陸當局的打壓，福建沿海間貨運停滯，漁民們因爲無法出航作業面臨失業，影響了全島大部分居民的生計。

從事公職的馬祖居民林先生表示，確有大量島民學煉過法輪功，認同法輪功是好的是勸善的，大陸當局無需如此緊張及打壓人民。

居民林先生：法輪功能夠得到億萬人的認同，一定有其正面的意義。我覺得有時候沒有必要小題大作。

大陸當局利用兩岸貿易的優勢，不斷對臺灣離島地區施加壓力，讓當地居民不得學煉法輪功，否則將無法進入大陸交易。這種挾經濟打壓人民信仰自由的做法，給兩岸三通政策蒙上一層陰影。