由于加拿大各地高校资金短缺，于是张开双臂欢迎孔子学院，并热衷于与之保持联系。但是，曾经欢迎过孔子学院的高校，现在对中共当局插手加拿大学术界感到不满。
《环球邮报》社论称，孔子学院由中共政权机构──国家汉办集中管理，而国家汉办隶属于教育部；作中共臂膀之一的统战部，负责向外输出软影响力，同时也插手这项文化输出的工作。
社论表示，其它大国中，也有类似的文化中心，如德国歌德学院，或法国的法语联盟。而孔子学院不同，它们通常被安置在现有的高校内，由学校通常提供教室和行政支持，而「国家汉办」提供教师和教学材料，外加启动及每年的运营成本（可以达到数十万元）。
社论称，作为中共文化宣传的一部份，在孔子学院英文网站上，面向「儿童及青少年」的「中国历史」部份，称中国的进步归功于中共。在推特上反复播出的题为「抗美援朝战争」的视频，声称「美国操纵联合国安理会扩大对朝鲜的侵略，」还鼓吹韩战中「志愿军」的作用。
这引起许多学者的不满，近年，从伦敦经济学院（London School of Economics）到卑诗大学，大学教授们提出了担忧。曼尼托巴大学（University of Manitoba）教授罗素（Terry Russell）表示「这相当于外国政府用我们的校园设立他们自己的教学计划，利用我们大学的威信，合法化他们的教课内容。」 罗素教授在2010年率先成功抵制在曼尼托巴大学建立孔子学院。
据《环球邮报》另一篇文章报导，一位曾经供职于安省汉密尔顿（Hamilton）麦克马斯特大学（McMaster University）孔子学院的教师说：「如果我的学生问我有关西藏或其他敏感话题，我应该有权告诉他们，以表达我的观点。但是，我不被允许自由说话。」 她透露：「在北京培训期间，他们告诉我们，不要谈论这个。如果学生坚持，你要尝试改变话题，或者说些中共喜欢的东西。」