对此，李提出申诉，称自己仅 工作作风和生活作风有问题，在经济上、政治上都是清白的，不怕审查，是令狐安组织人搞他的黑材料，并以绝食进行抗议。 与此同时，李在云南的同党、省长办公室主任沈某，在得悉李家属接到了李发自北京的“平安”电话后，随即动手销毁文件、资料。不意，令狐安掌控的省委、省纪委早有准备，就在沈消灭罪证的同时，被逮了个正着，当场搜去李、沈及其家属 、秘书、司机等已经签好证的加拿大等西方国家护照十三本（其中属李嘉廷本人的 就有五本），美元八十万、澳元一百五十万、泰铢七百三十万，七六型手枪三枝， 以及李通过云南在港中资机构、在京合资公司里通外国的相关文件。
六月十二日，中共中央特派员在昆明召集云南省常委会，宣布逮捕李嘉廷，撤销其省长、省委副书记和候补中央委员的职务，同时公开了李的六大罪状：
一、利用机构改革搞突击提干，仅副厅级就提了一百零二名；
二、省政府多个部门被黑社会控制，有的部门首长本人就是黑社会成员；
三、省政府行政开支帐目混乱，仅一九九九和二零零零两年就超支一百二十七亿，用于出国考察、超标建楼和私设的小金库；
四、擅自扣押据报省政府渎职、腐败、烂权的信件二百八十多封；
五、接受金钱及贵重礼品贿赂，已掌握的就有五十八万多元；
六、李嘉廷及其家属拥有的资产高达七百五十多万，同其实际收入明显不符。
李嘉廷被打倒，云南省委书记令狐安立刻乘机整肃异己，仅半个月的功夫就撤换了五十多名副厅级以上共干，二百多名处级党官。
来自云南的消 息称，在令同李的争斗、撕杀过程中，仅六月中旬就有三名副厅级共干永远“失踪 ”，是投“敌”还是被灭“尸”，各说不一。 中共云南省长被整肃，仅仅是十六大前省级诸侯大混战的一个侧面。最近，从广 东、辽宁、河北都传出了同样的刀枪箭戟之声，显示中共权争乱象已经如火如荼地 “红”遍了整个中国，它与北京高层的换届大拼杀遥相呼应，形成了一幅红朝覆灭前令国民极为振奋的《血染的风采》。