據香港明報報導，事發當日，朱溶基總理 就接到有關部門的報告，並隨即作出重要批示：請副總理吳邦國協調有關專家，調查原因，抓緊治理，確保人民生命財產的安全。在朱溶基指示下，吳邦國親自主持，調集了水利部、公安部、衛生部的有關專家商討對策，分派他們趕赴現場及污染流域各市，協助搶險。
同時，陝西省成立了由省委書記李建國和常務副省長賈治邦直接領導的搶險指揮部，並調集物資緊急運往事故現場。經中央軍委批准，解放軍駐陝某部派出一個連的防化部隊（即防化學和輻射武器部隊），趕到出事現場，負責重災現場的「解毒」搶險工作。
據目擊者稱，現場所見，出事河段被分成十多個格子，上面覆蓋着厚厚一層白色藥粉，河水則被格子擠往另一側向下流。據防化連朱姓參謀表示，出事河段往下十四公里是毒品污染最嚴重的地帶，已拋灑藥品進行化學分解中和。大量山奈在出事河段滲入地下，因而流向下游的氰化物相應減少，對下游危害應該不會很大。
當局在北京專家的建議下，還採取多項緊急措施，包括出動了大量人力，對事故現場進行二十四小時監控，在污染段河流上游築壩攔河，減緩污染水下排速度及下排量，在河段的下游也築壩攔截及過濾有毒污水。在污染嚴重的河段，則進行深度開挖，再將挖出的污染砂石進行中和處理，並將泄漏的事故車槽罐吊運到安全地帶進行生化處理。
雖然搶險工作及時有效，但據了解，由於現場污染源數量大（滲到水中的五噸山奈足可毒死二十五億人）、地形複雜、下雨等不利因素，「解毒」效果受到侷限，因此當局仍十分緊張，丹江、漢江及漢水流域的各城市均發出通告，禁止飲用江水，並向市民宣傳氰化物中毒解救常識，派發急救藥品。
湖北漢江水文局監測表明，毒水的擴散已到達丹江口水庫，庫區水質已開始受影響，但從丹江上游到下游，氰化鈉被江水逐漸稀釋，江水中氰化物含量逐步減少並趨穩定。該局總工程師郎理民稱，從水庫庫尾等控制斷面水取樣化驗，氰化物含量都低於每升零點零零五毫克，尚在國家飲用水標準之內，可以飲用，但他提醒居民目前最好不要直接從河內取水飲用。
據介紹，氰化鈉（ sodiumcyanide， NaCN），俗稱山奈，爲白色結晶粉末，屬劇毒化學用品。人若直接口服，致死量約爲一至兩毫克，即是說，五噸氰化鈉可直接毒死二十五億人。按香港政府頒佈的有關條例「健康危害資料表」顯示，氰化鈉容許溶度爲每立方米水量五毫克，立即危害濃度爲每立方米水量二十五毫克。
氰化鈉的毒性作用是在體內釋放氰基，與氧化型細胞色素氧化??的Fe3＋結合，使細胞色素失去傳遞電子能力，結果使呼吸鏈中斷，出現細胞內窒息，引起組織缺氧而致中毒死亡